蛋白質(zhì)的制備是一項非常詳盡的作業(yè)。觸及物理學、化學和生物學的常識很廣。近年來雖有了不少改善，但其首要原理仍不外乎兩個方面：一是運用混合物中幾個組分分配率的不同，把它們分配于可用機械辦法別離的兩個或幾個物相中，如鹽析、有機溶劑提取、層析和結(jié)晶等;二是將混合物置于單一物相中，經(jīng)過物理力場的效果使各組分分配于不同區(qū)域而到達別離的意圖，如電泳、超離心、超濾等。因為蛋白質(zhì)不能溶化，也不能蒸騰，所能分配的物相只限于固相和液相，并在這兩相間相互替換進行別離純化。制備辦法可按照分子巨細、形狀、帶電性質(zhì)及溶解度等首要因素進行分類。按分子巨細和形狀分為差速離心、超濾、分子篩及透析等辦法;按溶解度分為鹽析、溶劑抽提、分配層析、逆流分配及結(jié)晶等辦法;按電荷差異分為電泳、電滲析、等電點沉積、離子交換層析及吸附層析等;按生物功用專一性有親合層析法等。

　　因為不同生物大分子結(jié)構(gòu)及理化性質(zhì)不同，別離辦法也不一樣。即同一類生物大分子因為選用資料不同，運用辦法不同也很大。因而很難有一個統(tǒng)一標準的辦法對任何蛋白質(zhì)均可循用。因而試驗前應進行充沛調(diào)查研究，查閱有關文獻資料，對欲別離提純物質(zhì)的物理、化學及生物學性質(zhì)先有必定了解，然后再著手進行試驗作業(yè)。關于一個不知道結(jié)構(gòu)及性質(zhì)的試樣進行創(chuàng)造性的別離提純時，更需要經(jīng)過各種辦法比較和探索，才干找到一些作業(yè)規(guī)則和取得預期成果。其次在別離提純作業(yè)前，常須樹立相應的剖析判定辦法，以正確指導整個別離純化作業(yè)的順利進行。高度提純某一生物大分子，一般要經(jīng)過多種辦法、進程及不斷改換各種外界條件才干到達意圖。因而，整個試驗進程辦法的優(yōu)劣，挑選條件效果的好壞，均須經(jīng)過剖析判定來判明。

　　另一方面，蛋白質(zhì)常以與其他生物體物質(zhì)結(jié)合方式存在，因而也易與這些物質(zhì)結(jié)合，這給別離精制帶來了困難。如極微量的金屬和糖對巨大蛋白質(zhì)的安穩(wěn)性起決定效果，若被除掉則不安穩(wěn)的蛋白質(zhì)結(jié)晶化的難度也隨之增加。如頂峰淀粉酶 A的 Ca2+，胰島素 Zn2+等。此外，高分子蛋白質(zhì)具有必定的立體構(gòu)象，適當不安穩(wěn)，如前所述極易變性、變構(gòu)，因而限制了別離精制的辦法。通常是依據(jù)詳細對象聯(lián)用各種辦法。為得到天然狀況的蛋白質(zhì)，盡量選用溫文的手法，如中性、低溫、避免起泡等，并還要留意防腐。

　　留意共存成分的影響。如蝮蛇粗毒的蛋白質(zhì)水解酶活性很高，在別離純化中需引起注重。純化蝮蛇神經(jīng)毒素時，當室溫超過 20℃時，簡直得不到神經(jīng)毒素。蝮蛇毒中的蛋白水解酶能被 0.1mol/L EDTA徹底按捺，因而在進行柱層析前先將粗毒素 0.1mol/LEDTA溶液處理，即使在室溫高于 20℃，仍能很好的得到神經(jīng)毒素。

　　整個制備進程一般可分為 5個階段：①資料的挑選和預處理，②細胞的破碎(有時需進行細胞器的別離)，③提取，④純化(包含鹽析，有機溶劑沉積，有機溶劑提取、吸附、層析、超離心及結(jié)晶等)，⑤濃縮、枯燥及保存。以上 5個階段不是要求每個計劃都完整地具備，也不是每一階段截然分隔。

　　不論是哪一階段運用哪一種辦法，均必須在操作中保存生物大分子結(jié)構(gòu)的完整性。保存活性避免變性及降解現(xiàn)象的發(fā)生。因空間結(jié)構(gòu)首要依托氫鍵、鹽鍵和范德華力的存在，遇酸、遇堿、高溫、劇烈的機械效果及激烈的輻射等均可導致活性損失。因而挑選的條件應為非常溫文。一起應留意避免體系中重金屬離子、細胞本身酶系及其他有毒物質(zhì)的污染。

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